一、前期准备
在办理环境管理体系认证证书之前，企业需要进行充分的前期准备工作。要对企业的环境管理现状进行全面的评估，包括环境方针、目标、指标的制定与实施情况，环境因素的识别与评价，法律法规的遵守情况等。要组建专门的认证工作小组，明确小组成员的职责和分工，确保认证工作的顺利进行。还需要准备相关的文件和资料，如环境管理手册、程序文件、作业指导书等。
二、体系建立
在完成前期准备工作后，企业需要按照环境管理体系标准的要求，建立完善的环境管理体系。这包括制定环境方针和目标、识别和评价环境因素、确定适用的法律法规和其他要求、制定环境管理方案、建立组织机构和职责、制定环境管理程序和作业指导书等。在建立体系的过程中，要注重与企业的实际情况相结合，确保体系的有效性和可操作性。
三、体系运行
建立完善的环境管理体系后，企业需要进行体系的运行和维护。这包括按照环境管理体系文件的要求，开展各项环境管理活动，如环境监测、合规性评价、内部审核、管理评审等。要加强对员工的培训和教育，提高员工的环境意识和环境管理能力。通过体系的运行和维护，不断改进和完善环境管理体系，提高企业的环境管理水平。
四、认证申请
在体系运行一段时间后，企业可以向认证机构提出环境管理体系认证申请。认证机构会对企业的环境管理体系进行审核，包括文件审核和现场审核。文件审核主要是对企业提交的环境管理体系文件进行审查，确认其是否符合环境管理体系标准的要求。现场审核主要是对企业的环境管理体系运行情况进行实地检查，确认其是否有效运行。
五、认证决定
认证机构会根据审核结果，做出认证决定。如果企业的环境管理体系符合环境管理体系标准的要求，认证机构会颁发环境管理体系认证证书。认证证书的有效期一般为三年，企业需要在有效期内进行监督审核和再认证，以保持认证证书的有效性。
